MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 59475

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021030	TCG	2	6	191987	191992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185283
3002	NC_021030	CTT	2	6	192201	192206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3003	NC_021030	CTT	2	6	192235	192240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3004	NC_021030	CCCAA	2	10	192243	192252	40 %	0 %	0 %	60 %	479185283
3005	NC_021030	GTA	2	6	192263	192268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185283
3006	NC_021030	CGG	2	6	192366	192371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185283
3007	NC_021030	GGC	2	6	192375	192380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185283
3008	NC_021030	TTC	2	6	192410	192415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3009	NC_021030	TCGGTA	2	12	192473	192484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	479185283
3010	NC_021030	ACG	2	6	192527	192532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185283
3011	NC_021030	AAC	2	6	192596	192601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185283
3012	NC_021030	TCG	2	6	192654	192659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185283
3013	NC_021030	CTT	2	6	192798	192803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3014	NC_021030	TTC	2	6	192953	192958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3015	NC_021030	TCG	2	6	192965	192970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185283
3016	NC_021030	CTT	2	6	193003	193008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3017	NC_021030	CGT	2	6	193035	193040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185283
3018	NC_021030	AT	3	6	193064	193069	50 %	50 %	0 %	0 %	479185283
3019	NC_021030	TTC	2	6	193103	193108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185283
3020	NC_021030	TCGC	2	8	193136	193143	0 %	25 %	25 %	50 %	479185283
3021	NC_021030	TGCT	2	8	193160	193167	0 %	50 %	25 %	25 %	479185283
3022	NC_021030	CG	3	6	193354	193359	0 %	0 %	50 %	50 %	479185284
3023	NC_021030	TGG	2	6	193425	193430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185284
3024	NC_021030	TGT	2	6	193450	193455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185284
3025	NC_021030	CG	3	6	193488	193493	0 %	0 %	50 %	50 %	479185284
3026	NC_021030	GCC	2	6	193502	193507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185284
3027	NC_021030	GTT	2	6	193508	193513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185284
3028	NC_021030	CT	3	6	193515	193520	0 %	50 %	0 %	50 %	479185284
3029	NC_021030	AGGT	2	8	193638	193645	25 %	25 %	50 %	0 %	479185284
3030	NC_021030	CCG	2	6	193675	193680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185284
3031	NC_021030	TGG	2	6	193711	193716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185284
3032	NC_021030	CTT	2	6	193873	193878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185284
3033	NC_021030	CG	3	6	193879	193884	0 %	0 %	50 %	50 %	479185284
3034	NC_021030	CTT	2	6	193907	193912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185284
3035	NC_021030	TAC	3	9	193928	193936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185284
3036	NC_021030	TGC	2	6	193974	193979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185284
3037	NC_021030	GGC	2	6	193987	193992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185284
3038	NC_021030	GCT	2	6	194032	194037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185284
3039	NC_021030	TTG	2	6	194043	194048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185284
3040	NC_021030	AAC	2	6	194099	194104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185284
3041	NC_021030	GTC	2	6	194138	194143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185284
3042	NC_021030	CTA	2	6	194218	194223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185284
3043	NC_021030	TCG	2	6	194232	194237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185284
3044	NC_021030	ACG	2	6	194382	194387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185284
3045	NC_021030	TA	3	6	194417	194422	50 %	50 %	0 %	0 %	479185284
3046	NC_021030	GGC	2	6	194431	194436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185284
3047	NC_021030	GGC	2	6	194466	194471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185284
3048	NC_021030	CTTCC	2	10	194495	194504	0 %	40 %	0 %	60 %	479185284
3049	NC_021030	CAG	2	6	194545	194550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185284
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3051	NC_021030	TA	3	6	194633	194638	50 %	50 %	0 %	0 %	479185284
3052	NC_021030	TTC	2	6	194704	194709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185285
3053	NC_021030	GTT	2	6	194758	194763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185285
3054	NC_021030	TTC	2	6	194771	194776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185285
3055	NC_021030	T	7	7	194964	194970	0 %	100 %	0 %	0 %	479185285
3056	NC_021030	GAA	2	6	194983	194988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185285
3057	NC_021030	T	6	6	195011	195016	0 %	100 %	0 %	0 %	479185285
3058	NC_021030	TAA	2	6	195056	195061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185285
3059	NC_021030	TCT	2	6	195147	195152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185285
3060	NC_021030	TCG	2	6	195162	195167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185285
3061	NC_021030	TTAC	2	8	195177	195184	25 %	50 %	0 %	25 %	479185285
3062	NC_021030	TTC	2	6	195224	195229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185286
3063	NC_021030	CGT	3	9	195268	195276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185286
3064	NC_021030	CG	3	6	195290	195295	0 %	0 %	50 %	50 %	479185286
3065	NC_021030	CTT	2	6	195334	195339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185286
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3067	NC_021030	TAG	2	6	195486	195491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185286
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3070	NC_021030	CGG	2	6	195713	195718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185286
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3072	NC_021030	CTTC	2	8	195838	195845	0 %	50 %	0 %	50 %	479185286
3073	NC_021030	CTA	2	6	195862	195867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185286
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3087	NC_021030	CCAAG	2	10	196418	196427	40 %	0 %	20 %	40 %	479185286
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3089	NC_021030	TTC	2	6	196517	196522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185286
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3091	NC_021030	GTT	2	6	196604	196609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185286
3092	NC_021030	GCCC	2	8	196631	196638	0 %	0 %	25 %	75 %	479185286
3093	NC_021030	CGT	2	6	196702	196707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185286
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3101	NC_021030	AT	3	6	197171	197176	50 %	50 %	0 %	0 %	479185288
3102	NC_021030	CTG	2	6	197188	197193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185288
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3104	NC_021030	TTA	2	6	197225	197230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185288
3105	NC_021030	GCT	2	6	197281	197286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185288
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3109	NC_021030	GTTA	2	8	197708	197715	25 %	50 %	25 %	0 %	479185289
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3112	NC_021030	CCCG	2	8	197978	197985	0 %	0 %	25 %	75 %	479185289
3113	NC_021030	GCT	2	6	198010	198015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185289
3114	NC_021030	ACT	2	6	198030	198035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185289
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3116	NC_021030	GTAT	2	8	199048	199055	25 %	50 %	25 %	0 %	479185290
3117	NC_021030	ATT	2	6	199064	199069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479185290
3118	NC_021030	GTGG	2	8	199078	199085	0 %	25 %	75 %	0 %	479185290
3119	NC_021030	GTA	2	6	199139	199144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185290
3120	NC_021030	TCA	2	6	199178	199183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185290
3121	NC_021030	T	7	7	199205	199211	0 %	100 %	0 %	0 %	479185290
3122	NC_021030	ATG	2	6	199272	199277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185290
3123	NC_021030	ATACAA	2	12	199340	199351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	479185290
3124	NC_021030	CCG	2	6	199355	199360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185290
3125	NC_021030	TA	4	8	199374	199381	50 %	50 %	0 %	0 %	479185290
3126	NC_021030	TGC	2	6	199406	199411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185290
3127	NC_021030	ATA	2	6	199430	199435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185290
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3129	NC_021030	TAC	2	6	199476	199481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185291
3130	NC_021030	CGT	2	6	199616	199621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185291
3131	NC_021030	CTT	2	6	199646	199651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185291
3132	NC_021030	CGGT	2	8	199659	199666	0 %	25 %	50 %	25 %	479185291
3133	NC_021030	GTC	2	6	199710	199715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185291
3134	NC_021030	AAT	2	6	199944	199949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185292
3135	NC_021030	AAGC	2	8	199973	199980	50 %	0 %	25 %	25 %	479185292
3136	NC_021030	CTT	2	6	199998	200003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185292
3137	NC_021030	CGT	2	6	200060	200065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185292
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3141	NC_021030	GCCG	2	8	200220	200227	0 %	0 %	50 %	50 %	479185292
3142	NC_021030	CTT	2	6	200243	200248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185292
3143	NC_021030	T	6	6	200312	200317	0 %	100 %	0 %	0 %	479185292
3144	NC_021030	GT	3	6	200356	200361	0 %	50 %	50 %	0 %	479185292
3145	NC_021030	TAC	2	6	200448	200453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185292
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3147	NC_021030	TCT	2	6	200823	200828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185293
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3150	NC_021030	TTTC	2	8	200996	201003	0 %	75 %	0 %	25 %	479185293
3151	NC_021030	CTT	2	6	201042	201047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185294
3152	NC_021030	CGG	2	6	201064	201069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185294
3153	NC_021030	CTG	2	6	201106	201111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185294
3154	NC_021030	G	6	6	201111	201116	0 %	0 %	100 %	0 %	479185294
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3161	NC_021030	CTT	2	6	202091	202096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185295
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3233	NC_021030	T	6	6	206347	206352	0 %	100 %	0 %	0 %	479185300
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3238	NC_021030	TTC	2	6	206460	206465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185300
3239	NC_021030	TTGCT	2	10	206620	206629	0 %	60 %	20 %	20 %	479185300
3240	NC_021030	GTT	2	6	206635	206640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185301
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3242	NC_021030	GTT	2	6	206672	206677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185301
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3244	NC_021030	GCCG	2	8	206696	206703	0 %	0 %	50 %	50 %	479185301
3245	NC_021030	GTA	2	6	206731	206736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185301
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3351	NC_021030	TTAT	2	8	212157	212164	25 %	75 %	0 %	0 %	479185309
3352	NC_021030	GTT	2	6	212169	212174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185309
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3355	NC_021030	CCCGG	2	10	212325	212334	0 %	0 %	40 %	60 %	479185309
3356	NC_021030	AAT	2	6	212413	212418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185309
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3359	NC_021030	GCGG	2	8	212510	212517	0 %	0 %	75 %	25 %	479185310
3360	NC_021030	CCG	2	6	212566	212571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185310
3361	NC_021030	AAG	2	6	212579	212584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185310
3362	NC_021030	GTA	2	6	213098	213103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185311
3363	NC_021030	CGACGG	2	12	213129	213140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	479185311
3364	NC_021030	GTT	2	6	213196	213201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479185311
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3366	NC_021030	CTT	2	6	213282	213287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185311
3367	NC_021030	GTAT	2	8	213326	213333	25 %	50 %	25 %	0 %	479185312
3368	NC_021030	GCC	2	6	213396	213401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185312
3369	NC_021030	T	6	6	213499	213504	0 %	100 %	0 %	0 %	479185312
3370	NC_021030	TCT	2	6	213596	213601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185312
3371	NC_021030	AAAG	2	8	214024	214031	75 %	0 %	25 %	0 %	479185313
3372	NC_021030	TCG	2	6	214096	214101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185313
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3375	NC_021030	ATA	2	6	214223	214228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479185313
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3379	NC_021030	AAAAG	2	10	214341	214350	80 %	0 %	20 %	0 %	479185313
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3387	NC_021030	GCG	2	6	216875	216880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185315
3388	NC_021030	ATC	2	6	216919	216924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185315
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3392	NC_021030	GTG	2	6	217020	217025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185315
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3486	NC_021030	GCG	2	6	223480	223485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185318
3487	NC_021030	GGGTG	2	10	223486	223495	0 %	20 %	80 %	0 %	479185318
3488	NC_021030	TCT	2	6	223594	223599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185318
3489	NC_021030	AGG	2	6	223603	223608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185318
3490	NC_021030	GGA	2	6	223634	223639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185318
3491	NC_021030	GAT	2	6	223673	223678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185318
3492	NC_021030	GTG	2	6	223701	223706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185318
3493	NC_021030	GGC	2	6	223713	223718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185318
3494	NC_021030	CGG	2	6	223767	223772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185318
3495	NC_021030	GAT	2	6	223775	223780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185318
3496	NC_021030	GCG	2	6	223789	223794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185318
3497	NC_021030	GCC	2	6	223812	223817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185318
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3499	NC_021030	ACG	2	6	226816	226821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185319
3500	NC_021030	GCG	2	6	226953	226958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185319

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